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标题: 豆粑粑 tachyon render vmdscene.dat change size [打印本页]

作者: meatball1982 时间: 2018-3-30 12:43
标题: 豆粑粑 tachyon render vmdscene.dat change size
本帖最后由 meatball1982 于 2018-3-30 13:52 编辑

要画两堆I don't know what 的东西(pdb)
不只是要画里面，外面的边界也要画(dx)。
画出来还要好看。

用
vmd load pdb,
load dx
这些在附件里都有，主要主两个。
历为要突出中间红色的部分，这里的dx 透明度要高一些。
protein的黄色则要很透明。而transparent只能有一个透明程序。
感谢YB teach me.
vmd graphic materal
选transparent ,
点右侧
create new
比如叫material23
设置它的opacity为0.5
在画图时，两个不同的而
一个transparent
一个material23
就行。
注意：display-> render model-> GLSL

输出时，我用的是tachyon,但我的机器不行，
把你的vmd窗口变小，
render一下。
会生成一个vmdscene.dat
这个就是
下面的输入文件。这个可以扔一个core多的节点。要不我的机器，太慢。
用下面的命令。
注意vmd的路径可能要修改，
ubuntu是上面。
server的是下面。
具体的，可以-help 看。
效果刚刚。

#/usr/local/lib/vmd/tachyon_LINUXAMD64 -trans_vmd vmdscene.dat -o mm.tga
/opt/vmd-1.9.3/lib/tachyon/tachyon_LINUXAMD64 -trans_vmd vmdscene.dat -o mm.tga

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