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标题: pymol pml 命令行运行 command line [打印本页]

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作者: meatball1982    时间: 2023-10-9 15:29
标题: pymol pml 命令行运行 command line
pymol 命令行。

我想用pymol 实现两个pdb的对齐。

1. reinitialize
   
2. load ref.pdb, ref
   
3. load obj.pdb, obj
   
4. align obj,  ref and name ca
   
5. save mod.pdb,

复制代码

存成py_align.pml

在命令行运行
pymol -qc py_align.pml

-qc是个选项，在服务器上，不用这个，出毛病，
我理解是加载一个不用的库，还找不到。我直接不用了。

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