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豆粑粑 tinker potential生成 grid 点

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发表于 2017-3-16 17:01:31 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
本帖最后由 meatball1982 于 2017-3-16 17:06 编辑

QL 的问题,要生成一个protein周围的 grid点。用于比较电势之类的。
tinker的命令是potential,给xyz,prm就行。
另外,如果xyz的原子多,会提示要改变一个MAX的值 。在.f里面找到对应的值,变大,重新编译一次。

可以用protein生成 xyz,用xyzpdb生成 pdb


具体怎么编译,
http://www.ilovemathematica.com/ ... d=68&extra=page%3D1


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